esm

仓库创建 2025年10月20日最近提交 5 小时前SkillHot 收录 20 天前
▸ 精选理由

适合蛋白设计与分析,兼容 Forge/Biohub 推理与 ESMFold 流程。

▸ 风险提示

可能需访问托管服务或大量计算资源/模型权重

这个 Skill 做什么

使用 ESM 系列模型进行蛋白序列嵌入、生成与结构预测工作流。

用 ESM 模型做蛋白序列嵌入、生成和结构预测的一整套工作流,支持 ESM3、ESMC、Forge/Biohub 在线推理和 ESMFold2 折叠。常在做蛋白设计、表征学习或把序列转成向量、再做下游建模时用到。亮点是把生成、表征和全原子折叠流程连在一起,方便在同一套工具里跑端到端任务。

▸ 展开 SKILL.md 英文原文

Use when working directly with the `esm` Python SDK, ESM3 or ESMC model IDs, Forge/Biohub inference clients, or ESMFold2 folding workflows.

研究检索蛋白语言模型ESMFold序列嵌入通用
3.2w
Stars
3.2k
Forks
40
仓库内 Skill
+1.6k
7 日增星
安装 / 使用
给你的 Agent 一句话(通用)
帮我安装这个 skill:https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/main/skills/esm/SKILL.md
或 curl 直取 SKILL.md
curl -fsSL "https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/main/skills/esm/SKILL.md"
SKILL.MD 节选查看完整文件 ↗
# ESM: Evolutionary Scale Modeling

## Overview

ESM provides protein language models for understanding, generating, and designing proteins. Use this skill for current EvolutionaryScale/Biohub workflows: ESM3 for generative design, ESMC for representation learning and embeddings, hosted Forge/Biohub inference, and ESMFold2 all-atom structure prediction.

## Core Capabilities

### 1. Protein Sequence Generation with ESM3

Generate novel protein sequences with desired properties using multimodal generative modeling.

**When to use:**
- Designing proteins with specific functional properties
- Completing partial protein sequences
- Generating variants of existing proteins
- Creating proteins wit
via SKILL·HOT · 数据来自 GitHub 公开信息 · 原文版权归作者所有