depmap

仓库创建 2025年10月20日最近提交 5 小时前SkillHot 收录 20 天前

▸ 精选理由

便于筛选癌症特异性易感基因和验证药物靶点假设。

这个 Skill 做什么

查询 DepMap 中癌细胞系的基因依赖、基因效应与药敏数据。

通过 DepMap 查询癌细胞系的基因依赖性、基因效应和药敏数据，能找到哪些基因对特定细胞系是必需的或哪些药物有活性。常用于筛选肿瘤脆弱点、挖掘合成致死关系或验证药物靶点。特点是基于大规模 CRISPR（如 CRISPR Chronos）和 PRISM 化合物敏感性数据，样本量大、可比性强。

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Query the Cancer Dependency Map (DepMap) for cancer cell line gene dependency scores (CRISPR Chronos), drug sensitivity data, and gene effect profiles. Use for identifying cancer-specific vulnerabilities, synthetic lethal interactions, and validating oncology drug targets.

研究检索癌症依赖数据查询药敏信息通用

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# DepMap — Cancer Dependency Map

## Overview

The Cancer Dependency Map (DepMap) project, run by the Broad Institute, systematically characterizes genetic dependencies across hundreds of cancer cell lines using genome-wide CRISPR knockout screens (DepMap CRISPR), RNA interference (RNAi), and compound sensitivity assays (PRISM). DepMap data is essential for:
- Identifying which genes are essential for specific cancer types
- Finding cancer-selective dependencies (therapeutic targets)
- Validating oncology drug targets
- Discovering synthetic lethal interactions

**Key resources:**
- DepMap Portal: https://depmap.org/portal/
- DepMap data downloads: https://depmap.org/portal/download/all/
- P

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